Konsiderasyon jenetik

Staghorn koray nan Cane Bay, St. Croix. Photo © Kemit-Amon Lewis / TNC

Yon gwo objektif nan efò amelyorasyon popilasyon an gen ladan asire ke rekipere popilasyon koray yo se jenetikman divès. Jwenn moun ki jenetik ak swiv jenotip yo nan koray nan pepinyè ak pandan plant plant yo enpòtan pou alontèm nan siksè nan efò restorasyon ak popilasyon yo koray yo te retabli. Sa enpòtan sitou pou espès koray ki an danje oswa ki abondan paske yo te deja gen pwoblèm jenetik kote pèt dramatik nan koloni koray te redwi anpil materyèl jenetik (ki rele 'efè fondatè'). Se konsa, plizyè resous yo te devlope pou ede pratik restorasyon koray yo ogmante ogmantasyon divèsite jenetik nan koray kiltive yo ak plant yo.

Definisyon - gade nan Coral Genetics Research ak Restorasyon webinar pou plis deskripsyon

  • Divèsite jenetik - kantite alèl diferan nan yon popilasyon
  • Alèl yo - fòm altènatif nan yon jèn ki rive pa mitasyon epi yo jwenn nan menm kote a sou yon kwomozòm. Alèl yo enfliyanse pa imigrasyon nan nouvo alèl soti nan yon lòt kote nan popilasyon an ak mitasyon nan jèn nan alèl nouvo
  • Diferans jenotip - kantite klon oswa jenèz ki nan yon popilasyon (depi koray yo ka fragman, koloni endividyèl yo ka gen menm jenotip a epi yo dwe jenetikman idantifye)
  • Depresyon ... - yon rediksyon nan kondisyon fizik akòz kwaze nan fanmi; ka lakòz to fètilite diminye ak ogmante nan maladi
  • Depresyon an deyò - kapab rezilta nan kwazman ant moun ki gen rapò ak byen oswa kwazman ant moun ki ap fòtman adapte ak kondisyon lokal yo; sa ki lakòz pi ba kapasite pase paran yo, pote jèn yo ansanm ki pa travay byen ansanm yo paske yo te soti nan diferan anviwònman
  • Efè Fondatè - redwi divèsite jenetik lè yon popilasyon ap desann soti nan yon ti kantite zansèt kolonize yo

Risk jenetik ki asosye ak Retablisman

Eleman jenetik restorasyon an ta toujou pran an konsiderasyon pandan aktivite jadinaj koray yo paske metòd amelyorasyon popilasyon yo pran avantaj sou fwotman aseksyèl, kreye anpil koloni ki gen jenetikman idantifye (egzanp, klon). Si ti kras divèsite jenetik ki disponib pandan chòk fre pou repwodiksyon seksyèl, popilasyon an se nan risk pou andogisyon oswa lòt risk jenetik ki mennen nan redwi koray sante ak kondisyon fizik. Adisyon atifisyèl kèk jenotip ka diminye tou divèsite jenetik popilasyon sovaj ke yo te retabli.

Pepinyè Coral yo tou ka poze yon risk pou divèsite jenetik pa ekspoze koray nan yon roman oswa anviwònman kontwole ak kondisyon ki ka pa pi bon pou tout jenotip kenbe nan pepinyè la. Se konsa, kondisyon sa yo ka atifisyèlman chwazi pou kèk karakteristik jenetik, sa ki lakòz abuze nan yon sou nan jenotip ki byen nan pepinyè.

Enkòpore Jenetik nan Retablisman

Pratik jadinyè koray yo ta dwe vize a kilti ak outplant jan genotip anpil ke posib. Nan kolekte koray, operatè pepinyè yo ta dwe vize kolekte fragman nan zòn resif tankou anpil fizikman separe posib pou ogmante chans pou jwenn jenotip inik pou efò pwopagasyon. Yon kantite metòd jenetik yo egziste tou pou ede pratik yo detèmine si koray yo nan pepinyè yo genotip diferan, epitou yo mezire divèsite jenetik, estrikti jenetik popilasyon yo, andikap, efè fondasyon. Sa yo gen ladan makè mikrosatelit ak polimorfism sèl nukleotid (SNPs).

  • Makè mikrosatelitel - analize kantite pè baz repete nan yon alèl
    • Sèvi ak anplifikasyon PCR
    • Benefis: fleksib nan kantite echantiyon ke ou ka kouri, dosye done yo ti ak analiz jenetik se senp
    • Plizyè makè mikrosatelit te deja devlope pou koray Karayib yo ak Symbiodinium
  • Polimorfism Single Nukleotid (SNPs) - analize yon sèl baz chanjman pè nan yon sekans genomic
    • Li sèvi ak sekans RAD-tag
    • Dezavantaj: Dosye done yo gwo ak analiz egzije ekspètiz pwogramasyon an, bioinformatics yo difisil epi mande pou kèk ekspètiz

Si gen kèk koloni ki disponib pou peple pepinyè ou, li pa sijere pou w itilize fragman koray jenetikman depauperate, ki ka mennen nan plis redwi divèsite jenetik akòz selectivite segondè nan Pepinyè. Olye ke k ap deplase koloni koray soti nan plis Reef sit Reef, li se konseye ke pratik deplase gamèt koray atravè gwo distans, epi sibi pwosesis la nan éleve koray nan sèn nan larval jan yo ap gen chans pou gen pi bon siviv. Ankò, pou gamèt yo ke yo ranmase, elvaj diferan genotip se enpòtan pou restorasyon diminye deprime depresyon ak depresyon outbreeding.

Praktisyonè yo ta dwe kontinye pwopaje yon seri de janotip koray kèlkeswa yon si yon genotip montre pwodiktivite segondè oswa ba nan Pepinyè. Pou egzanp, pèfòmans nan yon genotip koray nan yon pepinyè pa toujou predi pèfòmans li yo lè anplantasyon, ak jenotip ka gen to kwasans lajman diferan depann sou kondisyon anviwònman an. ref Paske nan ekolojik natirèl komès-konpwomi nan itilizasyon resous, dousman ap grandi jenotip ka plis rezistan a latwoublay tankou tanperati cho. Se konsa, pratik yo pa ta dwe mankwote genotip ki klase anba lòt jenotip oswa referans pwogram an jeneral nan siviv ak kwasans. Pou detèmine ki jan diferan jenotip jis nan kondisyon diferan, li nan konseye ke pratik swiv tout jenotip nan Pepinyè ak apre ansanbl, osi byen ke pandan diferan kondisyon anviwònman an.

Nan ansanbl, pratik yo ta dwe plantasyon koray ki gen pépinière pou elve anndan kondisyon jeyografik ak anviwònman yo pou asire maksimòm siviv ak kapasite. Outplanting yon kantite diferan jenotip ki pi pre pral ogmante chans yo nan repwodiksyon siksè siksè ak règleman larva ki pral ede reyalize sit-lajè divèsite a te genotypic.

(ki soti nan Johnson et al. 2011)

(ki soti nan Johnson et al. 2011)