تجميع De Novo وشرح نسخة Acropora gemmifera Transcriptome

فبراير 22، 2018

الخلاصة: تنتشر الشعاب المرجانية الحجرية من جنس Acropora على نطاق واسع ، وهي بناة مهمة للشعاب المرجانية ، وقد أصبحت مستخدمة بشكل متزايد لفحص الروابط بين علم الوراثة وسلوك التفريخ. قمنا بتجميع وشرح نسخة مركبة من Acropora gemmifera باستخدام تحليل Illumina HiSeq2500 لمكتبتين من مراحل قمرية وشمسية مختلفة لتحديد الجينات التي لها أدوار وظيفية محتملة في السمات المتعلقة بالإنجاب. تم تجميع ما مجموعه 31.6 مليون قراءة أولية مجمعة باستخدام Trinity وتم دمجها في 104,000 contigs. تم إجراء الشرح الجيني الوظيفي باستخدام تحليل مسار dammit و Gene Ontology (GO) و KOG (WebMGA) و KEGG (Kaas). سيكون هذا المورد ذا قيمة للباحثين الذين يدرسون أنماط التعبير الجيني في دورات التكاثر المرجانية وتطور جنس Acropora.

كاتب: Oldach و MJ و PD Vize
السنة: 2018
عرض الملخص
البريد الإلكتروني للحصول على المقالة كاملة: resilience@tnc.org

علم الجينوم البحري. دوى: 10.1016 / j.margen.2017.12.007

آخـر الأخبار