De Novo Assembly and Annotation of the Acropora gemmifera Transcriptome

Feb 22, 2018

Famintinana: Ny vato harana avy amin'ny karazana Acropora dia miely patrana, manan-danja amin'ny fananganana haran-dranomasina ary mihamaro ny fampiasana azy amin'ny fanadihadiana ny fifandraisana misy eo amin'ny fototarazo sy ny fitondran-tena miteraka. Nanangona sy nanoratra transcriptome mitambatra avy amin'ny Acropora gemmifera izahay tamin'ny alàlan'ny famakafakana Illumina HiSeq2500 momba ny tranomboky roa avy amin'ny vanim-potoanan'ny volana sy ny masoandro mba hamantarana ireo fototarazo izay manana anjara asa mety amin'ny toetra mifandraika amin'ny fananahana. Mitotaly 31.6 tapitrisa ny fitambaran'ny vakiteny manta natambatra tamin'ny fampiasana ny Trinite ary namboarina ho contigs 104,000. Notanterahina tamin'ny fampiasana dammit, Gene Ontology (GO), KOG (WebMGA) ary KEGG pathway analysis (Kaas). Ity loharanon-karena ity dia ho sarobidy ho an'ny mpikaroka mianatra ny fomba fanehoana ny fototarazo amin'ny tsingerin'ny fananahana ny haran-dranomasina sy ny fivoaran'ny karazana Acropora.

Author: Oldach, MJ ary PD Vize
Taona: 2018
Jereo ny Abstract
Email ho an'ny lahatsoratra feno: resilience@tnc.org

Genomics an-dranomasina. doi:10.1016/j.margen.2017.12.007

Vaovao farany