Perhimpunan De Novo dan Anotasi Transkriptom Acropora gemmifera

Februari 22, 2018

Abstrak: Batu karang berbatu daripada genus Acropora diedarkan secara meluas, pembina terumbu yang penting dan semakin digunakan untuk menyiasat hubungan antara genetik dan tingkah laku pemijahan. Kami mengumpulkan dan membuat anotasi transkriptom komposit daripada Acropora gemmifera menggunakan analisis Illumina HiSeq2500 dua perpustakaan daripada fasa bulan dan suria yang berbeza untuk mengenal pasti gen yang mempunyai potensi peranan berfungsi dalam sifat berkaitan pembiakan. Sejumlah 31.6 juta gabungan bacaan mentah telah dipasang menggunakan Trinity dan dibina ke dalam 104,000 contigs. Anotasi gen fungsional dilakukan menggunakan analisis laluan dammit, Gene Ontology (GO), KOG (WebMGA) dan KEGG (Kaas). Sumber ini akan berguna untuk penyelidik yang mengkaji corak ekspresi gen dalam kitaran pembiakan karang dan evolusi genus Acropora.

Pengarang Oldach, MJ dan PD Vize
Tahun: 2018
Lihat Abstrak
E-mel untuk artikel penuh: resilience@tnc.org

Genomik Marin. doi:10.1016/j.margen.2017.12.007

Berita Terkini