บทคัดย่อ: ปะการังหินจากสกุล Acropora มีการกระจายอย่างกว้างขวาง เป็นตัวสร้างแนวปะการังที่สำคัญ และถูกนำมาใช้มากขึ้นในการตรวจสอบความเชื่อมโยงระหว่างพันธุกรรมและพฤติกรรมการวางไข่ เรารวบรวมและใส่คำอธิบายประกอบของทรานสคริปโตมแบบคอมโพสิตจาก Acropora gemmifera โดยใช้การวิเคราะห์ Illumina HiSeq2500 ของห้องสมุดสองแห่งจากระยะดวงจันทร์และดวงอาทิตย์ที่แตกต่างกัน เพื่อระบุยีนที่มีบทบาทการทำงานที่มีศักยภาพในลักษณะที่เกี่ยวข้องกับการสืบพันธุ์ การอ่านแบบรวมทั้งหมด 31.6 ล้านครั้งถูกรวบรวมโดยใช้ Trinity และสร้างเป็น 104,000 contigs คำอธิบายประกอบของยีนที่ทำหน้าที่ได้ดำเนินการโดยใช้ dammit, Gene Ontology (GO), KOG (WebMGA) และ KEGG pathway analysis (Kaas) แหล่งข้อมูลนี้จะเป็นประโยชน์สำหรับนักวิจัยที่ศึกษารูปแบบการแสดงออกของยีนในวงจรการสืบพันธุ์ของปะการังและวิวัฒนาการของสกุล Acropora
เขียนโดย: Oldach, MJ และ PD Vize
ปี: 2018
ดูบทคัดย่อ
อีเมลสำหรับบทความฉบับเต็ม: resilience@tnc.org
จีโนมิกส์ทางทะเล ดอย:10.1016/j.margen.2017.12.007
