Mga Pagsusuri sa Genetic

Staghorn Corals sa Cane Bay, St. Croix. Larawan © Kemit-Amon Lewis / TNC

Ang isang pangunahing layunin ng pagsisikap sa pagpapahusay ng populasyon ay may kasamang pagtiyak na ang pag-recover ng mga populasyon ng coral ay magkakaiba-iba sa genetiko. Ang pagkuha ng natatanging mga indibidwal na genetiko at pagsubaybay sa mga genotypes ng mga coral sa mga nursery at sa panahon ng outplanting ay mahalaga para sa pangmatagalang tagumpay ng mga pagsisikap sa pagpapanumbalik at ang mga populasyon ng coral na naibalik. Lalo na mahalaga ito para sa mga species ng coral na endangered o bihira, dahil malamang na nabawasan na ang pagkakaiba-iba ng genetiko at maaaring hindi matagumpay na reproductive sex, inaalis ang mga pagkakataon ng mga bagong kombinasyon ng genetiko na nagmumula nang natural.

Ang mga pangunahing tuntunin ay tinukoy sa ibaba bilang isang sanggunian:

Kahulugan - tingnan ang Coral Genetics Research and Restoration webinar para sa karagdagang paglalarawan

  • Allele - alternatibong anyo ng isang gene na lumilitaw sa pamamagitan ng pag-mutate at matatagpuan sa parehong posisyon sa isang chromosome. Maaari ring makarating ang mga Alleles sa pamamagitan ng imigrasyon mula sa ibang populasyon.
  • Mga Genet - mga kolonya na nabuo ng reproduction ng sekswal na magkakaiba ang genetiko. Ang isang natatanging kolonya ng coral ay kumakatawan sa isang solong genet (sa karamihan ng mga kaso), ngunit kung ang asexual reproduction ay nangyayari, maraming mga kolonya ang maaaring kabilang sa parehong genet, kung saan ang mga ito ay tinatawag na ramets.
  • Ramets - mga kolonya na nabuo ng asexual reproduction na magkapareho ng genetiko.
  • Pagkakaiba-iba ng genetiko - ang posibilidad na ang dalawang random na sampol na mga allel ay magkakaiba. Sinasalamin nito ang lawak ng hindi pagkakapareho ng genetiko sa pagitan ng mga genet sa isang populasyon.
  • Pagkakaiba-iba ng genotypic - ang proporsyon ng mga genet sa loob ng isang populasyon. Dahil ang mga coral ay maaaring magparami asexual, maraming mga kolonya (o mga ramet) ay maaaring kabilang sa parehong genet at samakatuwid ang pagkakaiba-iba ng genotypic ay maaaring mas mababa sa bilang ng kolonya)

Mga Pagkakataong Genetic na Nauugnay sa Panunumbalik

Ang pagkakaiba-iba ng genetiko at genotypic ng mga populasyon ng coral na naibalik ay dapat na laging isaalang-alang kapag nagsasagawa ng pagpapanumbalik gamit ang mga pamamaraan ng coral gardening. Sinasamantala ng mga pamamaraang ito ang asexual fragmentation, lumilikha ng mga kolonya na magkapareho ng genetiko (ibig sabihin, mga ramet na kabilang sa parehong genet). Kung ang pagkakaiba-iba ng genotypic ay mababa sa mga outplant site sa panahon ng pangingitlog para sa reproduction ng sekswal, ang populasyon ay nasa peligro dahil ang mababang pagkakaiba-iba ng genotypic ay maaaring humantong sa nabawasan na tagumpay sa pagpapabunga.

Pagsasama ng Genetics sa Pagpapanumbalik

Upang mai-minimize ang mga panganib na ito, ang mga tagapagsanay ng coral gardening ay dapat na hangarin sa kultura at paglabas ng maraming mga genet hangga't maaari. Ang mga sumusunod na tab ay nagsasama ng impormasyon tungkol sa kung paano isasama ang impormasyong genetiko sa iba't ibang mga aspeto ng mga pamamaraan sa paghahardin ng coral para sa pagpapanumbalik ng coral.

  • Kolektahin ang 3-6 coral genets bawat reef mula sa mga lugar ng reef na may iba't ibang mga kondisyon sa kapaligiran, perpektong kabilang ang mga lugar na gumagaya sa inaasahang mga kundisyon sa hinaharap
  • Upang makuha ang karamihan (> 50%) ng mga lokal na umaangkop na mga allel (mga alel na nagbigay sa isang coral ng kakayahang umunlad sa kasalukuyang kapaligiran), mangolekta mula sa hindi bababa sa 3 mga genet ng isang naibigay na site, o bahura; upang makuha ang 90%, mangolekta mula sa 10 mga genet (Baums et al. 2019).
  • Ang mga kolonya ng donor (kung saan nakolekta ang mga fragment ng coral) ay dapat na mas malaki sa 5m ang pagitan at genotyped gamit ang mga pamamaraang molekular genetika kung maaari.
  • Ang mga coral ay dapat kolektahin gamit ang pamamaraang ito mula sa isang hanay ng mga tirahan ng reef na may magkakaibang mga lokal na kondisyon sa kapaligiran, para sa isang minimum na 20-25 genet bawat species sa produksyon sa bawat nursery.
harang ng mga fragment ng coral ang nursery

Ang mga ramet (mga fragment ng coral) ng parehong genet na lumalaki sa isang istraktura ng nursery na bloke. Pinagmulan: Coral Restorasi Foundation. Larawan © Tim Calver

  • Ang mga corals ay dapat na subaybayan sa paglipas ng panahon batay sa kanilang genet o lahi. Maaari itong magawa sa pamamagitan ng pagtatalaga ng isang genet bawat istraktura ng nursery o paggamit ng mga tag o plug / puck na may genet Ang isang puwang para sa "hindi kilalang mga genotypes" ay dapat italaga para sa mga kolonya na nasisira o naging dislodged at ang kanilang genet ay hindi kilala. Ang mga kolonya na iyon ay maaari pa ring itaguyod sa pag-unawa na ang genet ay hindi kilala. Kung walang magagamit na data ng molekular genetiko, maaaring ipahiwatig ang lipi na may isang natatanging ID na naaayon sa kolonya ng donor.
  • Ang mga ugaling na Phenotypic na makakatulong na gabayan kung aling mga corals ng nursery ang magpapatuloy na palaganapin kasama ang: mababang antas ng background ng bahagyang dami ng namamatay (dami ng pagkawala ng tisyu), mabilis na pagpapagaling ng sugat (araw upang pagalingin mula sa pagkakapira-piraso), mataas na rate ng paglaki ng kalansay (buoyant weight o "area ng korona "), Pagpapaputi at nakakahawang paglaban ng sakit o katatagan (walang pagpapaputi / nakakahawang sakit, mabagal na rate ng paglala ng sakit, at / o mabilis na paggaling), at mataas na output ng reproductive sex (pangingitlog at paggalaw ng tamud) (Baums et al. 2019).
  • Ang mga genet na nagpapakita ng mahinang fitness sa nursery ay maaaring mapalitan ng iba pa mula sa parehong reef (Baums et al. 2019). Ang pagbubukod ng mga kolonya na ito mula sa nursery ay malamang na hindi makaapekto sa representasyon ng pagkakaiba-iba ng genetiko hangga't mapanatili ang representasyon mula sa iba't ibang mga tirahan. Ang mga nakaligtas sa mga genet na nakalaan para sa kapalit ay maaari pa ring maitaguyod nang direkta (tingnan sa ibaba).
  • I-outplant ang proporsyonal na representasyon ng lahat ng mga genet mula sa mga stock ng nursery sa bawat site na outplant (Baums et al. 2019)
  • Ang paglabas ng 4-6 iba't ibang mga genet na malapit sa malapit upang madagdagan ang mga pagkakataong matagumpay ang pagpaparami ng sekswal ay makakatulong na maitaguyod ang isang sariling nagtaguyod na populasyon.
  • Posible na ang ilang mga genet ay maaaring na-disadya sa nursery ngunit naangkop nang maayos sa reef; sa mga kasong iyon, maaaring isaalang-alang ng isang nagsasanay ang pagtanggal sa yugto ng nursery at paglabas ng halaman nang direkta mula sa magulang na kolonya hanggang sa bahura. Ang isang genet ay maaari ring mapanatili sa nursery sa kabila ng mahinang pagganap kung ang pagsubaybay sa mga outplant site ay nagpapahiwatig na ito ay isang mataas na tagapalabas na naunang na-outplanted (O'Donnell et al. 2018).

Mga Kagamitan sa Genetic

Ang isang bilang ng mga pamamaraang molekular genetikong umiiral upang matukoy kung ang mga coral sa mga nursery ay kabilang sa iba't ibang mga genet, pati na rin ang pagsukat ng pagkakaiba-iba ng genetiko at istraktura ng populasyon ng genetiko (Baums et al. 2019). Dalawang karaniwang ginagamit na diskarte ay kinabibilangan ng:

  • Mga marker ng microsatellite - pinag-aaralan ang mga bilang ng mga motif (ulitin ang mga pares ng base) sa isang allele
    • Maraming mga marka ng microsatellite ang nabuo na para sa mga corals ng Caribbean at Symbiodiniaceae (Baums et al. 2019)
    • Mga Pakinabang: kakayahang umangkop sa bilang ng mga sample na maaaring patakbuhin; ang mga file ng data ay maliit; ang pagtatasa ng genetiko ay prangka
    • Mga drawbacks: masipag sa paggawa upang masubukan ang maraming loci, ang pagmamarka ng mga alleles ay mahirap na i-automate, ang mga resulta ay hindi madaling maihambing sa mga laboratoryo
  • Mga solong nucleotide polymorphism (SNPs) - pinag-aaralan ang mga pagkakaiba ng solong base pair sa isang pagkakasunud-sunod ng genome
    • Mga Pakinabang: mas madaling i-automate at i-outsource, mas maraming loci ang maaaring masubukan sa isang oras upang magbigay ng buong impormasyon sa genome; ang mga pamamaraan ay higit na maisasagawa sa pagitan ng mga lab; ang mga pamamaraan na batay sa pagsunud-sunod ay hindi nangangailangan ng pagbuo ng platform at maaaring mailapat kaagad sa anumang species.
    • Mga drawbacks: ang pagsusuri ay nangangailangan ng kadalubhasaan sa bioinformatics upang makuha ang mga genotypes mula sa pagsunud-sunod ng output.
pporno youjizz xmxx guro xxx Kasarian
Translate »