Acropora gemmifera 轉錄組的從頭組裝和註釋

2018 年 2 月 22 日

摘要:鹿角珊瑚屬的石珊瑚分佈廣泛,是重要的造礁者,並且越來越多地用於研究遺傳學和產卵行為之間的聯繫。 我們使用 Illumina HiSeq2500 分析來自不同月相和日相的兩個文庫,組裝並註釋了 Acropora gemmifera 的複合轉錄組,以確定在生殖相關性狀中具有潛在功能作用的基因。 使用 Trinity 組裝了總共 31.6 萬個合併的原始讀數,並構建到 104,000 個重疊群中。 使用該死的基因本體論 (GO)、KOG (WebMGA) 和 KEGG 通路分析 (Kaas) 進行功能基因註釋。 該資源對於研究珊瑚繁殖週期和鹿角珊瑚屬進化中的基因表達模式的研究人員非常有價值。

作者: Oldach、MJ 和 PD Vize
年份:2018
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全文電子郵件:resilience@tnc.org

海洋基因組學。 doi:10.1016/j.margen.2017.12.007

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