保護草食動物
食草動物，對於支持珊瑚礁恢復力和防止大型藻類過度生長的珊瑚至關重要。 珊瑚礁管理者可以通過調節海洋保護區中食草動物的清除以及與漁民和漁業管理者合作來保護更廣泛的珊瑚礁生態系統中食草動物種群的生存能力，從而在食草動物保護中發揮關鍵作用。 漁業立法為保護食草動物提供了法律框架，但大多數現有的漁業管理戰略並未旨在保護食草動物等功能性角色。
一系列常規漁業管理工具和策略可用於保護食草動物。 這些包括：
保護區
禁止在部分棲息地或對食草動物重要的地點（例如聚集地）移除食草動物（或普遍禁止捕魚）有助於維持食草動物種群。
齒輪限制
草食動物通常不會被鉤釣捕撈，而是使用陷阱、網或矛作為目標。 一些食草魚類，例如鸚嘴魚，特別容易受到夜間魚叉捕魚和水肺魚叉捕魚的傷害。 限制使用某些類型的漁具或捕魚時間可以減少對食草動物的壓力。
物種禁令
保護食草動物最有效的方法是全面禁止採集主要食草動物物種。 現在已經在包括伯利茲在內的幾個地方實施了這項措施。 基於市場的方法，例如禁止銷售食草動物，可以阻止對食草物種的商業捕撈，儘管自給漁業在許多地方仍然是一個重要的壓力來源。
臨時關閉
在殺死珊瑚的干擾事件（例如颶風或大規模珊瑚白化）之後，食草動物的作用尤其重要。 管理人員可以考慮對重要的食草動物物種的捕撈進行臨時限制，以最大限度地提高珊瑚種群能夠恢復的機會，而不會增加與藻類過度競爭的壓力。
草食動物恢復
在草食動物種群因過度捕撈或疾病而減少的情況下，積極恢復可能是將種群重建到防止或逆轉相移所需的水平的最可行方法。 在一些地方，枯竭的海膽種群一直是輔助恢復試驗的重點，它們是食草動物的主要來源之一（這可能是魚類食草動物種群枯竭的症狀），但還沒有任何成功大規模恢復的例子.
鸚嘴魚控制藻類生長並維持珊瑚礁基質以供珊瑚補充。 照片 © Jeff Yonover
為了控制夏威夷毛伊島珊瑚礁上的海藻過多 Kahekili草食動物漁業管理區 建立了。 它的目的是通過漁業管理方法來增加某些草食性魚類和海膽的局部豐富度。 例如，孵化場飼養的幼崽（Tripneustes gratilla已經被釋放到珊瑚礁上以放牧入侵的藻類並促進珊瑚礁的恢復。
視頻： 使用草食動物拯救珊瑚礁 （2：39）
夏威夷州水產資源部門的達拉懷特描述瞭如何管理珊瑚礁的恢復能力。
海藻的自然控制旨在幫助該地區的海洋生態系統恢復健康的平衡。 管理區域禁止捕撈以下家庭中的任何魚類：Kyposidae（海鱸），Scar科（parrotfishes）或Acanthuridae（外科魚類）或任何海膽。