Abstract: Ang mabato na mga korales mula sa genus na Acropora ay malawak na ipinamamahagi, mahalagang mga tagabuo ng bahura at lalong ginagamit para sa pagsisiyasat ng mga link sa pagitan ng genetika at pag-uugali ng pangingitlog. Nag-assemble kami at nag-annotate ng isang composite transcriptome mula sa Acropora gemmifera gamit ang pagsusuri ng Illumina HiSeq2500 ng dalawang library mula sa iba't ibang lunar at solar phase upang matukoy ang mga gene na may potensyal na gumaganang tungkulin sa mga katangiang nauugnay sa reproductive. Isang kabuuang 31.6 milyong pinagsamang hilaw na pagbabasa ang na-assemble gamit ang Trinity at binuo sa 104,000 contigs. Ang functional gene annotation ay isinagawa gamit ang dammit, Gene Ontology (GO), KOG (WebMGA) at KEGG pathway analysis (Kaas). Ang mapagkukunang ito ay magiging mahalaga para sa mga mananaliksik na nag-aaral ng mga pattern ng pagpapahayag ng gene sa mga coral reproductive cycle at ebolusyon ng genus Acropora.
May-akda: Oldach, MJ at PD Vize
Taon: 2018
Tingnan ang Abstract
Mag-email para sa buong artikulo: resilience@tnc.org
Marine Genomics. doi:10.1016/j.margen.2017.12.007
